История начинается с того, что 17-летний Синъити Кудо, известный гениальный подросток, который помогал полиции раскрывать самые запутанные преступления, становится случайным свидетелем деятельности тайной преступной организации под названием Черный Синдикат. Бандиты заставляют его принять экспериментальный яд APTX 4869, но вместо смерти парень чудом выживает и превращается в семилетнего мальчика.
